1996
Mediante Resolución N° 036 emitida por el Rector General se nombra al Reverendo Padre Fr José Antonio Balaguera Cepeda O.P., para dirigir la naciente Sede de Tunja
2000
Adquisición de terrenos para el Campus universitario con un área de 44,482,56 m²
2001
Inauguración del Edificio San Alberto Magno 7 de marzo de 2001.
2002
Por medio de la Resolución No. 316 del 25 de febrero de 2002 el Ministerio de Educación Nacional otorgar a la Sede de Tunja la denominación de Seccional, esto bajo la dirección del Padre Fray José Antonio Balaguera Cepeda, O.P.
2003
El 29 de julio de 2003 fue designado como Rector de la Seccional Tunja el Padre Fray Faustino Corchuelo Alfaro, O.P.
Inauguración del Edificio Fr. Giordano Bruno, O.P. y Escenarios Deportivos
2006
El Padre Fray Carlos Mario Álzate Montes, O.P. fue nombrado como Rector de la Seccional Tunja por un periodo de 3 años
Se realiza la apertura Centro de Atención Universitaria CAU en la Ciudad de Tunja
2009
El Consejo de Fundadores nombra al Padre Fray Luis Alberto Orozco Arcila, O.P. como Rector de la Seccional Tunja hasta el año 2012.
Para esta vigencia fue ejecutado el Plan de Desarrollo 2010- 2012.
2010
Premio Sol de Aquino en categoría oro entregado por el Consejo Superior de la Universidad Santo Tomás Seccional Tunja.
El Senado otorgó a la Universidad, Orden de Congreso de Colombia en el grado de Comendador.
La Gobernación de Boyacá otorgó la Orden de la Libertad en el grado de Oficia
El Concejo Municipal Concedió la Orden Gustavo Rojas Pinilla en el Grado de Oficial a la Seccional Tunja
2013
Fray Aldemar Valencia Hernández, O.P. es nombrado como Rector de la Universidad Santo Tomás Seccional Tunja,
El Plan de Desarrollo 2013 – 2015 “Sempre Quaerere, Semper Studere, Sempre”
2015
Fue designado en año el Padre Fr. Eduardo González Gil
2016
La Universidad Santo Tomás Colombia recibió por parte del Ministerio de Educación Nacional la Acreditación Institucional de Alta Calidad Multicampus
Formulación Plan Integral Multicampus PIM 2016-2027
Formulación Plan de Desarrollo Tunja 2016-2019
2017
Por un período de tres años, fue nombrado por el Consejo de Fundadores el Padre Fr. Jorge Ferdinando Rodríguez Ruíz, O.P. como Rector de la Universidad Santo Tomás Seccional Tunja.
La Universidad Santo Tomás recibió por parte de ICONTEC la certificación del Sistema de Gestión de la Calidad bajo la NTC ISO 9001:2015, con el alcance: diseño, desarrollo y prestación del servicio de educación superior en programas de pregrado y posgrado, presencial y a distancia.
2018
La Universidad adquirió un predio en el Centro Histórico de la Ciudad de Tunja y le fue constituida como Campus Casa Tomasina
La Universidad ingresa al ranking británico internacional QS en donde obtuvo el galardón de tres estrellas en QS STARS RATED FOR EXCELLENCE.
El Instituto Internacional para el Aseguramiento de la Calidad (IAC), dependencia del Centro Interuniversitario de Desarrollo (CINDA), otorgó mediante Acuerdo No. 55 del 9 de mayo de 2019, la Acreditación Institucional Internacional por un período de 5 años al Primer Claustro Universitario de Colombia.
2019
El Instituto Internacional para el Aseguramiento de la Calidad (IAC), dependencia del Centro Interuniversitario de Desarrollo (CINDA), otorgó mediante Acuerdo No. 55 del 9 de mayo de 2019, la Acreditación Institucional Internacional por un período de 5 años al Primer Claustro Universitario de Colombia.
El Consejo de Fundadores nombró el Padre Fray Álvaro José Arango Restrepo, O.P. como Rector de la Universidad Santo Tomás Seccional Tunja hasta el año 2022.
Plan de Desarrollo 2020-2022: Juntos lo Soñamos, Juntos lo construimos y juntos lo haremos realidad.
Fue inaugurado el Edificio Santo Domingo De Guzmán en el Campus Avenida Universitaria.
2021
25 Años de la Seccional haciendo presencia en la Ciudad de Tunja
2022
2022
El Consejo de Fundadores nombró a Fray Álvaro José Arango Restrepo, O.P. como rector de la Seccional Tunja por un periodo de tres años, mediante decreto Número 134 del 31 de mayo de 2022. Mediante la Resolución N° 014525 de 2022, del Ministerio de Educación Nacional (MEN), se otorga la renovación de la Acreditación Institucional de Alta Calidad Multicampus por un periodo de 8 años. Con el Plan Seccional de Desarrollo 2022-2025 “más allá de tus límites” se define el horizonte de la seccional hasta el 2025.
2023
2023
El Consejo de Fundadores nombró a Fray José Fernando Mancipe, O.P. como nuevo rector de la Seccional Tunja por un periodo de tres años, mediante decreto Número 155 del 31 de julio de 2023.